14年前,初(chū )号机(jī )疑似神化(huà )第一(yī )形态的觉(jiào )醒带来近三冲击,使世界发生前所未有的巨变。在此(cǐ )之后,葛城美里(lǐ )(三(sān )石琴乃 配(pèi )音)等NERV旧部出(chū )走,成立了反抗seele和NERV的Wille。Wille授命明日香(宫村优子 配音)和真里(坂本(běn )真绫(líng ) 配音)夺(duó )回被(bèi )封印在卫(wèi )星轨(guǐ )道上的初(chū )号机和碇真嗣(绪方惠美 配音),但绝对禁止真嗣(sì )登上初号机。感(gǎn )受到(dào )周遭的敌(dí )意,懵(měng )懂的真嗣(sì )跟随绫波丽(林原惠美 配音)登上突然入侵的九号机,返回了千(qiān )疮百(bǎi )孔的NERV总部(bù )。在这(zhè )里,他意外(wài )重逢朝思夜想(xiǎng )的绫波,还从父亲那里得知自己将和美少年渚薰(石田(tián )彰