14年前,初号机疑(yí )似神化第一形态的觉(jiào )醒带来近三冲(chōng )击,使世界发生(shēng )前所未有的巨(jù )变。在此之后,葛(gě )城美里(三石(shí )琴乃 配音)等NERV旧部出(chū )走,成立了反抗(kàng )seele和NERV的Wille。Wille授命明日(rì )香(宫村优子(zǐ ) 配音)和真里(lǐ )(坂本真绫 配(pèi )音)夺回被封印在卫(wèi )星轨道上的初(chū )号机和碇真嗣(sì )(绪方惠美 配(pèi )音),但绝对禁(jìn )止真嗣登上初(chū )号机。感受到周(zhōu )遭的敌意,懵懂的真嗣(sì )跟随绫波丽(林原惠美 配音(yīn ))登上突然入(rù )侵的九号机,返(fǎn )回了千疮百孔(kǒng )的NERV总部。在这里,他意外(wài )重逢朝思夜想(xiǎng )的绫波,还从父(fù )亲那里得知自(zì )己将和美少年(nián )渚薰(石田彰(zhāng )